1988年2月至8月，海军根据国务院和中央军（委）的决定，在南沙群岛永暑礁建起一座有人驻守的海洋观测站，并在5个附属礁盘上建起10座钢筋水泥基座航标灯，塔身采用玻璃钢制成，高7米，直径1.8米。
目前礁上守军200余人，其中包括无线电，雷达和油料及维护人员。建筑包括一个直升机平台，一个4000吨级码头，一座2层楼房，和一个500平方米的蔬菜棚。
4.南薰礁
南薰礁位于北纬10度13分，东经114度12分，在郑和群礁西南端。是一个巨大的礁盘，礁盘上有两处退潮露出礁体。南部小礁石，现取名为小南熏礁，并为我军控制。水深在6米以内。南薰礁上建有第3代永固式高脚屋和一个补给平台。
5.赤瓜礁
赤瓜礁位于北纬9度43分，东经114度18分，因附近盛产赤瓜参而得名。整个赤瓜礁为一个呈三角形的巨大礁盘，礁内有次成泻湖发育，已形成一个小环礁地形。次成泻湖已为白沙填充，呈狭长状，东北有缺口于外海相通。礁盘上有褐色火山岩出露出海面1.3米。
1988年3月13日，我海军在赤瓜礁建立的防卫哨，历经10年，从第一代“茅棚”，到第二代“钢凉亭”，再到第三代钢筋混凝土结构，有卫星通讯设施，设有灯塔和一运输补给码头，有相当好的防护能力。
当第三代高脚屋完成后，守礁战士仍舍不得拆除简陋第一代高脚屋，因为在寸土如金的南沙，有一个“散步”“休息”场所是很很珍贵的。
6.东门礁
东门礁位于北纬9度53分，东经114度27分。东门礁位于九章群礁北部中央，邻近安乐礁和西门礁，为有数个暗礁、沙滩组成的急陡之礁湖，海水低潮时礁盘上有露出水面之礁岩。1988年我海军进驻东门礁目前已经建造了一个第三代永固式高脚屋，包括一个补给平台。几座第一代高脚屋仍然保留。守备部队：守备第4连，目前无一般平民居住，仅时有中国渔船避风。
7.渚碧礁
位于北纬10度54分，东经114度06分，是一个不规则多角形环形的环礁，长约6.5公里，宽约3.7公里。涨潮淹没，退潮露出。礁内泻湖水深10～22m，最大水深24m，可以停泊任何吨位的船舶。南部有小礁门，只有小船能进入礁湖，一般船只停在环礁外。这是由于环礁礁盘发育完整之故。湖中水色蓝绿。
中国于1988年在渚碧礁建立了第一代高脚屋，随后于90年代后期扩建成第三代建筑物。岛上有马头和直升机停机坪。我军在渚碧礁修建了远程雷达站并部署有一个排的兵力，可监控南海
8.华阳礁
在永暑礁南方41海里处，礁盘呈弓形，长约5.6公里，浅湖小而且没有口门地形发育。北面礁盘有两块海拔1.2-1.6米的礁石出露，潮差为2米左右。礁坡较陡。1988年，我海军开始在华阳礁建立防卫哨现在已经是第3代永固式“高脚屋”。华阳礁整个建筑包括一个永固式高脚屋，一个补给平台，几个第一代高脚屋。战备储藏包括：82天的食物，5吨油料，和380吨水。守备部队：守备第2连
9.美济礁
位于北纬9度54分00秒，东经115度32分00秒，是一个椭圆形的珊瑚环礁，顶部全由珊瑚构成，东西约9公里，南北约6公里，总面积约46平方公里。四周礁石在退潮时露出水面6英尺，礁盘以外约1公里处，水深可达千米以上。环礁内泻湖面积约36平方公里，水深20米～30米。
南部和西南部有三个礁门，南门西水道有37米宽，长275米，水深18米以上，大型船只可以在涨潮时通过该口进入泻湖，为一天然避风良港。目前由中华人民共和国南海渔正部门管理，有大量中国渔民常年居住在此进行远洋渔业捕捞和网箱养殖。
其战略地位极其重要，目前我国驻军此一点，并全面控制周边的牛鈪礁、安达礁、三角礁、五方礁、仁爱礁、信义礁、半月礁、仙娥礁、仙宾礁、半日礁、北恒礁、孔明礁等12小礁。
10.南钥岛
位于北纬10度41分，东经114度25分，道明群礁的最南部。该岛呈圆形，岛直径约300米，海拔1.8米，高度只有中业岛的五分之一，是南沙群岛中最低的小岛。它所在的小礁盘也呈圆形，直径约1.2公里。岛缘沙滩有200-500米，小岛有沙堤围绕，高6米，中为洼地。岛上灌木茂密，高3-4米，中部有椰子林，水井及房屋，并有小庙一座，大约是清代道光年间所建。1933年，法国人驻军此处，1943年日本侵占了该岛，1950年代，美国派兵侵占了南钥岛，但1959年后放弃。1968年后，菲律宾侵占该岛。1994年，中菲海军在南钥岛海域有场小规模的冲突，其结果菲2艘炮艇被击沉，数名士兵死亡。岛上的一些建筑被摧毁，包括一个瞭望塔，此后，菲放弃了该岛，随后被我军控制，限于《南海各方宣言》目前岛上没有直接驻军，但有中国军事人员活动。
11.马欢岛
在北纬10度44分，东经115度48分。位于南沙群岛北部。岛近长圆形，东西长约360米，南北宽约270米，面积约0.06平方公里。岛上杂草丛生，无树木。挖沙2尺，可得淡水，且水质好，可供饮用。海鸟栖居甚多。1970年曾被菲律宾侵占，驻军4人（后仅留1人驻守）并搭建木屋一座，后木屋被台风摧毁后菲方人员下落不明。目前有少量中国渔民常在本岛搭棚居住，有的长达数年，以捕捞海龟和其他海产为生。有的则以此处作为中转点，以补给淡水。依托本岛的礁盘不大，岛附近水深可锚泊。
12.西月、费信、北子岛
注：以上三岛曾被菲律宾侵占，2007年在中国国务院总理温家宝对菲律宾进行访问之际，中菲两国签署一系列协议，后菲律宾正式撤出了在西月、马欢、费信、南钥、北子岛上的驻军（有的早已无驻军），认同“两国可以自由投资，共同发展以上岛屿经济”（因菲根本无财力投资，等同实质退出）。中国承诺在未来5～7年内斥资49亿美元投资菲律宾农业。但2009年3月10日菲律宾总统阿罗约正式签署“领海基线法”，又将以上岛礁和黄岩岛划入菲领土，中国随即对以上岛屿派出武装人员并加强了“渔正”巡逻，反之弱小的菲军根本无力对之实行有效控制
13.双黄沙洲
（LoaitaNan）有两个沙洲组成，分别位于北纬10度41分，东经114度25分（东北）和北纬10度42.5分，东经114度19.5分（西南）。西南部分没于水下，东北部分露出水面；无树木生长。根据部分国外资料显示，双黄沙洲自1988年后有我国气象观测人员不间断驻守。